Методом выбора для стерилизации металлических инструментов является стерилизация в суховоздушных стерилизаторах при t- 1800C в течение 60 минут.
Для стерилизации коррозионностойких инструментов может применяться автоклавирование при давлении в 2,9 атм (1320 С.) в течение 20 минут.
Одноразовые инструменты (пинцеты, зажимы, зонды, скальпели) стерилизуются с помощью ионизирующего излучения в заводских условиях.
Изделия, применяемые в стоматологии(боры зубные, головки алмазные, дрильборы, а также рабочие части гладилок, экскаваторов, зондов и др.) стерилизуют в среде нагретых стеклянных шариков (гласперленовая стерилизация).
Методом выбора для стерилизации оптических инструментов(лапароскопия, торакоскопия),инструментов, содержащих термолабильные элементы, является газовая стерилизация (смесь ОБ) или замачивание в растворах химических средств (Бианол, Лизоформин-3000, Глутарал, Сайдекс, Стераниос и др.)